世界農(nóng)化網(wǎng)中文網(wǎng)報(bào)道:以色列植物基因公司Evogene近日宣布推出用于新型化學(xué)除草劑開發(fā)的計(jì)算機(jī)靶標(biāo)研發(fā)平臺(tái)PoinTar,這在新型化學(xué)除草劑探索項(xiàng)目中具有重大里程碑意義。該平臺(tái)中的靶標(biāo)即負(fù)責(zé)雜草生物學(xué)過程的關(guān)鍵化學(xué)分子,這些化學(xué)分子可能具有防除雜草的潛在作用。
全球每年由雜草造成的作物損失預(yù)計(jì)達(dá)1000億美元以上,而目前市場(chǎng)價(jià)值約200億美元的化學(xué)除草劑是雜草防控的主要手段。由于雜草對(duì)除草劑的抗性不斷提高,入侵植物不斷出現(xiàn),而近20年來卻沒有新作用機(jī)理的除草劑推向市場(chǎng),所以市場(chǎng)對(duì)新除草劑解決方案具有較大的需求。
Evogene除草劑研發(fā)項(xiàng)目從2012年開始啟動(dòng),通過整合了生物和化學(xué)預(yù)測(cè)功能的計(jì)算機(jī)平臺(tái)的發(fā)展,來解決目前新除草劑作用機(jī)理的問題。
PoinTar平臺(tái)的推出是該項(xiàng)目的首個(gè)關(guān)鍵點(diǎn)。該平臺(tái)除了對(duì)潛在靶標(biāo)的預(yù)測(cè)外,另一個(gè)重要特征是以諸如“成藥性”等結(jié)構(gòu)信息為基礎(chǔ),優(yōu)先開發(fā)具有這類性質(zhì)的蛋白質(zhì)。“成藥性”是指預(yù)測(cè)的靶標(biāo)與化學(xué)分子反應(yīng)的能力。此外,PoinTar可以識(shí)別非轉(zhuǎn)錄RNA作為潛在靶標(biāo),將這類一直以來被忽視的分子加入到識(shí)別過程中。這兩種以計(jì)算機(jī)為基礎(chǔ)的特征結(jié)合有望提供一種特殊而高效的靶標(biāo)研發(fā)能力。
建立Evogene除草劑研發(fā)能力的另一個(gè)關(guān)鍵過程是完成第二個(gè)互補(bǔ)平臺(tái)用以發(fā)現(xiàn)化學(xué)分子,專門抑制通過PoinTar平臺(tái)發(fā)現(xiàn)的靶標(biāo)的活動(dòng)。這些化學(xué)分子將作為最終除草劑產(chǎn)品的活性成分。
“我們正在開展的除草劑開發(fā)項(xiàng)目依靠我們兩個(gè)核心資產(chǎn),即我們高通量且具專利的數(shù)據(jù)整合和分析計(jì)算機(jī)能力,以及我們對(duì)作物在基因?qū)用嫒绾喂ぷ鞯纳羁痰念A(yù)測(cè)性理解?!盓vogene的總裁兼首席執(zhí)行官Ofer Haviv說,“通過利用這些基礎(chǔ)研發(fā)實(shí)力,該項(xiàng)目把生物和化學(xué)方面的相關(guān)知識(shí)整合到一個(gè)完整解決方案中,專門設(shè)計(jì)出新的強(qiáng)大的研發(fā)手段,這是整個(gè)農(nóng)業(yè)領(lǐng)域最重要的挑戰(zhàn),也是最大的商機(jī)之一。”